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NVIDIA DGX A100助力百图生科构建生物计算引擎

星星科技指导员 来源:NVIDIA 作者:NVIDIA 2022-05-20 15:07 次阅读

案例简介

• 本案例中通过 NVIDIA DGX A100 80GB 和 NVIDIA 网络交换机,百图生科构建了独特的生物计算引擎,建立高质量、高效率的靶点筛查和药物设计,从而构建药物研发平台。从海量生物数据与信息中抽取知识,绘制 “BioMap” ,将创新药物研发的 “大海捞针” 变为 “按图索骥” 。

• 本案例主要应用到 DGX A100 80GB; NVIDIA 网络交换机。

• 本案例中, NVIDIA 精英级合作伙伴信弘智能助力百图生科部署了高效的 AI 计算平台。

客户简介及应用背景

百图生科(BioMap)是一家生物计算驱动的生命科学平台公司,致力于将先进 AI 技术与前沿生物技术相结合,构建独特的靶点挖掘及药物设计能力,开发创新的药物和诊断产品。

利用生物计算引擎,加速对复杂疾病机理的发现进程,从而提升生命科学研发的效率。

百图生科基于 NVIDIA DGX A100 80GB 和自身庞大的计算能力,构建独特的生物计算引擎,提高了计算密度、性能和灵活性。

客户挑战

为了开发和整合多种先进的 AI 算法,芯片,传感器,多组学分析,类器官模拟等技术,构建独特的生物计算引擎,建立高质量、高效率的靶点筛查和药物设计能力,构建基于高维度多组学、高通量干湿试验闭环、高精准抗体设计、高性能生物计算平台能力,百图生科希望利用生物计算引擎,构建强大的 AI 技术及计算平台和前沿生物技术平台,希望开发针对生物计算需求的超级计算集群、高性能蛋白质计算芯片、高性能图数据库、高等级的数据安全与隐私计算引擎,支撑 EB 级别的海量数据存储计算需求,比如超大规模的蛋白质预训练模型、图神经网络靶点分析、蛋白质结构预测和模拟。通过强大的算力服务器支持,可以帮助实现快速解决更庞大、更复杂的数据科学问题,更好地建立生物计算引擎和强大的 AI 技术及计算平台。

应用方案

基于以上挑战,百图生科采用了 NVIDIA DGX A100 80GB,将深度学习训练、推理和分析整合至一个易于部署的统一 AI 基础架构中,拥有一个更简单快捷的解决人工智能的方法。

百图生科参考了 DGX A100 的标准架构和网络互联建议,决定按标准建议进行网络改造,采用了NVIDIA 网络交换机,其中将 NVIDIA InfiniBand QM 8700 做计算互联, NVIDIA Ethernet MSN3700 做存储和管理网络,可以让整个集群全线速计算,提高跨节点使用效率。

使用效果及影响

当前生物医药行业普遍面临一个非常严峻的问题,即“双十定律”,具体来说就是一款新药从研发到上市,平均需要 10 年时间和 10 亿美元的投入,且成功率不足 10%。越来越多的医药企业在寻求如何利用人工智能技术提高行业的运行效率。

当前基因技术的发展已经进入到数据爆发式增长的阶段,随着更多组学数据的不断积累,包括血液、组织、器官等宏观系统的连续观测数据的结构化都在逐渐成熟之中;人工智能新的算法应用也涉及到了很多领域,如无人驾驶人脸识别、复杂的知识图谱构建等;成熟的云计算服务也在为各行各业的转型发展提供强大的算力支持, AI 技术赋能生物制药行业加快发展的基本条件都已具备。 “作为生物计算引擎驱动的创新药物研发平台,借助 NVIDIA AI 计算平台。在蛋白质结构预测、亲和力预测等场景, NVIDIA DGX A100 相比其他硬件解决方案计算性能提升了 10-20 倍。百图生科将更高效地利用前沿生物技术 + AI,解决生命科学行业的高价值问题,携手行业伙伴打造创新药物管线,助力人类健康事业发展。” 百图生科副总裁周达表示。

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    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  产品类型特性 加速度计类型 : MEMS DC 即插即用加速度计传感器类型 : 直流响应即插即用加速度计 结构特性 电气连接 : 一体式电缆 电气特征 满量程输出电压 (VDC): ±2 励磁电压 (VDC): 8 – 36 零加速输出 (mV): ±100 励磁电流 (mA): 5 信号特征 频率响应 (Hz): 0-800 主体特性 轴数 : 1 重量 : 7 g [ .245 oz ] ...
    发表于 08-21 01:00 96次 阅读

    603-0100-120 603-0100-120 速率和惯性传感器

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  产品类型特性 速率和惯性传感器类型 : Rate Sensors/Gyros 电气特征 励磁电压 (VDC): 5 – 16 尺寸 尺寸 MM : 20.8 x 20.8 x 14.5 使用环境 工作温度范围 : -40 – 105 °C [ -40 – 221 °F ] 包装特性 速率和惯性传感器包装 : Anodized Aluminium 其他 精确度 : ±0.5% Non-Linearity FS 范围 (±) DEG/SEC : 100...
    发表于 08-21 01:00 66次 阅读

    20010631-00 610-12K-276 速率和惯性传感器

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  产品类型特性 速率和惯性传感器类型 : Rate Sensors/Gyros 电气特征 励磁电压 (VDC): 5 – 16 尺寸 尺寸 MM : 14.6 x 10.2 x 7.6 使用环境 工作温度范围 : -40 – 105 °C [ -40 – 221 °F ] 包装特性 速率和惯性传感器包装 : Anodized Aluminium 其他 精确度 : ±0.5% Non-Linearity FS 范围 (±) DEG/SEC : 12000...
    发表于 08-21 01:00 54次 阅读

    62105012-000 62105012-000 位置传感器配套仪表

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  电气特征 线路电源电压要求 (VDC): ±12, ±15 信号调节 - LVDT/RVDT 输出类型 (VDC): ±10 励磁电压 (Vrms): 3 信号特征 励磁频率 (kHz): 2.5 – 10 机械附件 信号调节 - LVDT/RVDT 安装 : Printed Circuit Board Edge or Terminal Block 使用环境 工作温度范围 : -1 – 55 °C [ 30 – 130 °F ] 其他 传感器类型 : 带 5 或 6 根导线的 LVDT 或 RVDT 传感器通道 : 1 ...
    发表于 08-21 01:00 68次 阅读

    67010001-000 67010001-000 线性位移传感器 - LVDT

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  使用环境 工作温度范围 : 5 – 60 °C [ 41 – 140 °F ]
    发表于 08-21 01:00 62次 阅读

    7104A-0050 7104A-0050 即插即用加速度传感器

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  产品类型特性 加速度计类型 : IEPE 即插即用加速度计传感器类型 : 交流响应即插即用加速度计 结构特性 电气连接 : 10-32 同轴连接器 电气特征 满量程输出电压 (VDC): ±5 励磁电压 (VDC): 18 – 30 励磁电流 (mA): 2 – 10 信号特征 频率响应 (Hz): 0.3-10000 主体特性 轴数 : 1 重量 : 8.6 g [ .303 oz ] 材料 : 不锈钢 ...
    发表于 08-21 01:00 53次 阅读

    72162000-020 72162000-020 倾角传感器和倾角仪

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  结构特性 接口 : 模拟 电气特征 电源电压 (VDC): 12 – 24 模拟接口 (mA): 4 – 20 端接特性 倾角传感器和测斜仪安装 : 垂直 尺寸 尺寸 (mm): 最多 70 倾角传感器和测斜仪精确度 (°): 最多 +/- .5 分辨率 (°): 最多 +/- .01 使用环境 测量原理 : 液体 工作温度范围 : -25 – 60 °C [ -13 – 140 °F ] 包装特性 倾...
    发表于 08-21 01:00 47次 阅读

    11106140-00 AST4300A05000P4P1000 压力传感器

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  产品类型特性 压力传感器类型 : 非易燃压力变送器 压力类型 : 测量仪 结构特性 压力端口/接头 : 1/4 MNPT 电气连接 : 10 英尺导管 电气特征 压力传感器电源电压 (V): 10 – 28 主体特性 端口材料 : 316L 使用环境 压力 : 344.73 bar [ 5000 psi ] 工作温度范围 : -40 – 80 °C [ -40 – 176 °F ] 操作/应用 耐压范围 : 2X,最小值 ...
    发表于 08-21 01:00 121次 阅读

    11108715-00 AST4600A02000P4W1000 压力传感器

    看产品文档,或 联系我们 以了解最新的机构审批信息。  产品类型特性 压力传感器类型 : 防爆型压力变送器 压力类型 : 测量仪 结构特性 压力端口/接头 : 1/4 MNPT 电气连接 : 导管 2 m 引线 电气特征 压力传感器电源电压 (V): 10 – 28 主体特性 端口材料 : 316L 使用环境 工作温度范围 (°C): -40 – 85 工作温度范围 (°F): -40 – 185, -40 – 185 操作/应用 耐压范围 : 2X,最小值 ...
    发表于 08-21 01:00 74次 阅读