冷冻电镜技术是解析生物大分子三维结构的关键手段,曾获2017年诺贝尔化学奖,并在新冠病毒结构解析中发挥重要作用。然而,该技术的数据处理面临图像信噪比低、计算规模巨大、重构耗时长等挑战,尤其在大规模原位结构解析中缺乏高效算法与软件支持。
经过长期技术攻关,北京理工大学基于“DeepAI深算智能引擎+国产GPU加速卡”,成功研发具有自主知识产权的大规模冷冻电镜图像原位重构软件——DisSPA,通过中科曙光提供的国产算力实现对冷冻电镜图像的高效、高精度原位结构解析,标志着我国在生物计算与结构生物学交叉领域取得重要突破。
项目团队创新性提出并实现了基于国产GPU加速卡的并行化缓存方案与多卡GPU-FFT技术,显著降低预处理时间与内存负载,解决了传统方法中模板匹配效率低、存储需求大等瓶颈。
在实际测试中,DisSPA在国产GPU单卡上相比CPU单核实现高达961.9倍的性能提升,相比32核CPU也有30.9倍性能提升。在处理400张大规模图像数据时,仅需22分钟即可完成重构,远超传统处理效率。
目前,DisSPA已完成在多家单位的应用示范,支持红藻捕光系统、酵母核糖体等典型生物结构的原位解析,验证了其在高精度结构解析中的可靠性与实用性,具备大规模对外服务能力。
未来,北京理工大学将与中科曙光持续推进DisSPA的推广应用,开展系列培训与学术交流,助力更多生物学家高效获取高分辨率原位结构,推动我国在结构生物学与人工智能交叉领域的前沿发展。
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原文标题:北京理工大学 × 曙光AI,生物结构解析快近1000倍!
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