如何使用docker和python工具包datmo为数据科学和AI框架快速配置环境

无论是第一次设置TensorFlow的新手数据科学爱好者，还是使用TB级数据的经验丰富的AI工程师，安装库、软件包或者框架总是一个困难又繁琐的过程。但是像Docker这样的集装箱化工具正在彻底改变着软件的可重复性，只不过它们还没有在数据科学和人工智能社区中流行起来。但随着机器学习框架和算法的不断发展，我们将很难花时间专注于学习所有相关的开发人员工具，尤其是那些与模型构建过程没有直接关联的工具。

在这篇文章中，我将展示如何使用docker和python工具包datmo为任何流行的数据科学和AI框架快速配置环境。

一.Docker

1.docker是什么

该软件于2013年由dotCloud 公司推出，发布以来一直备受关注和讨论，被认为可能会改变软件行业。

2.为什么使用docker

如果让你说出软件开发最烦人的事情，那么环境配置必然是其中之一。例如开始编写Python应用程序，那么你的第一个步骤就是在您的计算机上安装Python。软件运行时，你不仅需要让自己计算机上的环境需适合你的应用程序按预期运行，并且还需要与生产环境相匹配。这就是所谓的环境一致性问题。这里面大量的重复劳动不说，还经常出现系统不兼容等莫名其妙的问题，非常令人崩溃。很可能再自己机器上跑通了，但放到用户的环境里，或者服务器上就出问题了。

那么可不可以在软件安装的时候把软件需要的环境一并复制过去呢？虚拟机（virtual machine）就是带环境安装的一种解决方案。它可以在一种操作系统里面运行另一种操作系统，但它的缺点很多：资源占用多、冗余步骤多、启动慢等等。

Docker是一种全新的虚拟化方式。传统虚拟机技术是虚拟出一套硬件后，在其上运行一个完整操作系统，在该系统上再运行所需应用进程；而容器内的应用进程直接运行于宿主的内核，容器内没有自己的内核，而且也没有进行硬件虚拟。因此容器要比传统虚拟机更为轻便。在这样的前提下，它跟传统的虚拟化方式相比具有众多优势：

高效的利用系统资源。

启动速度快。容器里面的应用，直接就是底层系统的一个进程，而不是虚拟机内部的进程。由于直接运行于宿主内核，无需启动完整的操作系统，因此可以做到秒级、甚至毫秒级的启动时间。

确保了应用运行环境一致性。

可以在很多平台上运行，无论是物理机、虚拟机、公有云、私有云，甚至是笔记本，其运行结果是一致的。

容器只要包含用到的组件即可，而虚拟机是整个操作系统的打包，所以容器文件比拟机文件要小很多。

3.如何使用docker

首先要理解Docker的三个概念：镜像、容器、仓库。

镜像（Image）和容器（Container）的关系，就像是面向对象程序设计中的类和实例一样，镜像是静态的定义，容器是镜像运行时的实体。容器可以被创建、启动、停止、删除、暂停等。镜像是只读的，可以用来创建Docker容器，容器看做是一个简易版的Linux环境（包括root用户权限、进程空间、用户空间和网络空间等）和运行在其中的应用程序。

Docker Registry是集中存放镜像文件的场所，提供集中的存储、分发镜像的服务。一个 Docker Registry中可以包含多个仓库（Repository）；每个仓库可以包含多个标签（Tag）；每个标签对应一个镜像。

最常使用的 Registry 公开服务是官方的 Docker Hub，这也是默认的 Registry，并拥有大量的高质量的官方镜像。

这里以TensorFlow机器学习框架搭建为例讲解如何利用docker快速搭建环境。

首先你需要安装并启动Docker。如果要使用GPU则安装nvidia-docker。

1）直接使用别人做好的镜像

在命令行输入以下两条命令：

docker image pull tensorflow/tensorflow docker run -it -p8888:8888-v /$(pwd)/notebooks:/notebooks tensorflow/tensorflow

第一行命令在Docker Hub上拉取tensorflow官方镜像的cpu版本。

第二行则由此镜像创建一个容器，并在容器里运行jupyter服务。在你的浏览器上打开http://localhost:8888/，就可以在jupyter里导入TensorFlow包了。

-v 参数的作用是将宿主机当前目录下的notebook目录挂载到容器内的/notebooks目录，不添加这个参数的话，当结束 container 的时候，jupyter notebook 里的内容也会随之消失。

我们还可以进入到容器里查看容器的环境配置信息：

docker run -it -p 8888:8888 tensorflow/tensorflow bash

解释一下参数含义：

-i：以交互模式运行容器，通常与 -t 同时使用

-t：为容器重新分配一个伪输入终端，通常与 -i 同时使用

bash：在容器内执行bash命令

root@21cebb7bd6b4:/notebooks# python Python2.7.12(default, Dec 42017,14:50:18) [GCC5.4.020160609] on linux2 Type"help","copyright","credits"or"license"formore information. >>> import tensorflow >>> root@21cebb7bd6b4:/notebooks# python3 Python3.5.2(default, Nov232017,16:37:01) [GCC5.4.020160609] on linux Type"help","copyright","credits"or"license"formore information. >>> import tensorflow Traceback (most recent call last): File"", line1,in ImportError:Nomodulenamed'tensorflow'

2）保存修改后的容器为新的镜像

通过在容器里执行bash命令后我们可以看到，TensorFlow官方提供的这个容器的环境已经安装了Python2和Python3，不过只有在python2上安装了TensorFlow的环境，如果你想在python3运行TensorFlow的话，可以自己手动在容器里进行你喜欢的环境配置。

有没有办法把修改好的容器作为基础镜像，以后需要创建容器的时候都使用这个新的镜像呢？通过命令docker commit [CONTAINER]可以提交容器副本，制作属于你自己的镜像。命令格式如下：

dockercommit-m="description"-a="ahthorName"97744639b45d ahthorName/tensorflow-python3:latest

参数说明：

-m:提交的描述信息

-a:声明镜像作者

97744639b45d：容器ID

ahthorName/tensorflow-python3指定要创建的目标镜像名

docker ps -a这条命令可以列出所有已经创建的未删除的容器。

这里分享一个docker hub 上的镜像docker pull dash00/tensorflow-python3-jupyter，里面已经配置好了python3下TensorFlow的环境，大家可以直接拉取使用。

3）dockerfile定义全新镜像

上面的方法是在基础镜像的容器上做修改创建我们自己的镜像，我们也可以编写一个Dockerfile来构建全新的镜像。我们已经知道Docker镜像是制作Docker容器的模版，而Dockerfile则是一个定义Docker镜像的文件。下面我们尝试编写一个Dockerfile。

Dockerfile定义了容器内的环境配置。在此环境中，对网络接口和磁盘驱动器等资源的访问都是虚拟化的，该环境与系统的其他部分隔离。因此您需要将端口映射到外部的宿主机环境，并具体指定哪些文件是跟外部环境保持一致的。只要在定义好此操作之后，你就可以预期，无论什么时候你运行这个文件，由Dockerfile中定义的应用程序环境的构建都会执行完全相同的操作。

如何创建

这里是一个示例：创建一个空目录，创建一个名为的文件dockerfile，再创建两个文件requirements.txt和app.py和dockerfile放在一起。

以下是dockerfile文件内容，注释里有条语句的解释：

#使用python:2.7-slim作为基础镜像 FROM python:2.7-slim #指定工作目录（或者称为当前目录） WORKDIR /app #将当前文件夹下的内容（requirements.txt和app.py）复制到容器里的/app目录下 ADD . /app #安装在requirements.txt文件里指定的python包 RUN pip install --trusted-host pypi.python.org -r requirements.txt #向外部环境暴露80端口 EXPOSE 80 #设置环境变量 ENV NAME World #一旦容器开始运行，则运行app.py作为容器的主进程 CMD ["python", "app.py"]

FROM指定基础镜像，是必备的指令，并且必须是第一条指令。在 Docker Store 上有非常多的高质量的官方镜像提供给我们使用。

RUN 指令是用来执行命令行命令的。

CMD 指令用于指定默认的容器主进程的启动命令。有别于传统虚拟机概念，对于容器而言，其启动程序就是容器的主要进程，容器就是为了主进程而存在的。

有了Dockerfile 文件，我们就可以使用docker image build命令创建 image 文件了。运行：

#-t参数用来指定 image 文件的名字 Docker build -t friendlyhello

如果运行成功，使用docker image ls命令就可以看到新生成的 image 文件friendlyhello了，它位于你机器的本地Docker镜像注册表中。

docker imagels REPOSITORY TAG IMAGE ID friendlyhello latest 326387cea398

二.Datmo

如果你觉得上面描述的关于docker的操作依然十分麻烦的话，我还有一个工具推荐给你，那就是datmo。Datmo充分利用了Docker，简化了流程，帮助您快速轻松地运行AI框架。下面是使用流程：

1.前提条件

安装并启动Docker（https://docs.docker.com/install/#supported-platforms）

（如果使用GPU）安装CUDA 9.0（https://developer.nvidia.com/cuda-90-download-archive）

（如果使用GPU）安装nvidia-docker（https://github.com/datmo/datmo/wiki/Datmo-GPU-support-and-setup）

2.安装datmo

就像任何python包一样，使用以下命令从终端安装datmo：

$ pip install datmo

3.初始化datmo项目

在终端中，打开项目文件夹。然后，输入以下命令：

$ datmo init

然后，你将被要求提供项目的名称和描述。

4.启动环境设置

在输入名称和描述后，datmo将询问是否要设置环境 - 输入y并按enter。

5.选择系统驱动程序（CPU或GPU）

然后，CLI将询问希望为您的环境选择哪些系统驱动程序。如果不打算使用GPU，请选择cpu。

6.选择一个环境

接下来，你将从众多预打包环境中选择一种。只需在提示中回复您要使用的环境的编号或ID。

7.选择编程语言版本

上述许多环境都有不同的版本，具体取决于你计划使用的语言和版本。

例如，在选择keras-tensorflow环境后，我将面临以下提示，询问我是否要使用Python 2.7或Python 3.5。

8.启动工作区

现在是时候启动你的工作区了。选择你要使用的工作区，然后在终端中输入相应的命令。

Jupyter Notebook - $ datmo notebook JupyterLab - $ datmo jupyterlab RStudio -  $ datmo rstudio（在R-base环境中可用） 终端模式 - $ datmo terminal

责任编辑：lq