NVIDIA借助AI和仿真推动医疗健康研究

四家位于英国的 NVIDIA 初创加速计划会员公司使用 Cambridge-1 系统，借助 AI 和仿真推动医疗健康研究。

四家 NVIDIA 初创加速计划会员公司拔得头筹，成为首批使用英国最强大超级计算机 Cambridge-1 的初创公司。

这几家英国公司分别是 Alchemab Therapeutics、InstaDeep、Peptone 和 Relation Therapeutics。他们将使用该系统，实现数字生物学方面的突破。

Cambridge-1 于 2021 年 7 月正式推出，是基于 NVIDIA DGX A100 系统、BlueField-2 DPU 和 NVIDIA InfiniBand 网络的 NVIDIA DGX SuperPOD 集群，凝聚了 NVIDIA 在加速计算、AI 和生命科学领域数十年的工作成果。该计算机位于伦敦和剑桥之间，是全球最快的 50 台计算机之一，并且 100% 采用可再生能源供电。

该超级计算机的五家创始合作伙伴已经在利用它来推动医疗健康领域的进展，利用 AI 研究痴呆等脑部疾病、研发新药等。

现在，这四家初创公司计划使用 Cambridge-1 来加速药物研发、基因组测序和疾病研究。

这四家初创公司都是 NVIDIA 初创加速计划会员，这项免费计划旨在为初创公司提供尖端技术，助力他们颠覆行业发展。该计划为会员提供量身定制的持续性福利，如 NVIDIA 深度学习培训中心(DLI)积分、市场营销支持和专家技术支持。

Alchemab Therapeutics：发现抗体疗法

Alchemab Therapeutics 正在研究新药靶标和治疗方案，并构建患者分层工具，他们的初始目标是神经退行性疾病和癌症。

Alchemab 技术主管 Jake Galson 表示，公司的抗体药物研发引擎基于“大自然最有效的搜索引擎——适应性免疫”而构建。当人体的免疫系统对致病性蛋白质(如癌症产生的蛋白质)或外来微生物(如感染)做出反应时，就会产生适应性免疫。

Alchemab 的平台对 B 细胞进行测序(B 细胞会产生抵抗疾病的抗体)，并对容易感染某些疾病，但能够快速康复的个体进行抗体反应计算分析。

“人体抗体的种类可能有约 10 万亿之多，而使用 Cambridge-1 为我们提供了独特的机会，让我们可以从如此海量的数据中解读有意义的信息，” Galson 说，“这将加深我们对抗体结构和功能的理解，并最终推动新疗法的问世。”

InstaDeep：为生物学创建决策系统

InstaDeep 是 NVIDIA 合作伙伴网络的精英成员，致力于提供 AI 决策系统，助力推动新一代疫苗和疗法的发展。

该公司正致力于使用基因组学数据来训练大型 AI 语言模型，并与医疗健康研究人员共享该模型，使其能够将此用于蛋白质设计和分子动力学仿真。

“公开可用的核苷酸序列有超过 120 亿个，来自 450,000 个物种，” InstaDeep 联合创始人兼首席执行官 Karim Beguir 说，“利用大规模模型，从基因组学测序中获得数据驱动型洞察，将使研究人员和生命科学专家获益匪浅。”

Beguir 表示，作为一家初创公司，使用 Cambridge-1 极大地增强了 InstaDeep 的“能力和雄心，进而迎难而上，为患者开发创新疗法”。

Peptone：深入探索无序蛋白质

Peptone 是一家初创公司，在去年秋天获得了 Cambridge-1 早期使用机会，他们正在开发一个名为 Oppenheimer 的物理引擎，该引擎将有助于研究人员了解固有无序蛋白质 (IDP) 的精确结构，这种蛋白质没有固定的 3D 结构。

Peptone 创始人兼首席执行官 Kamil Tamiola 表示，IDP 疾病通常难以治疗，但在 Cambridge-1 的助力下，Peptone 有望“将通常无药可及的 IDP 转化为合理的药物靶标。”

“超级计算机将使我们能够在几个小时内，针对数百万种蛋白质，并行地执行高吞吐量推理，”Tamiola 说，“Oppenheimer 将先进的原子级生物物理学实验与基于 NVIDIA DGX A100 的新一代超级计算机堆栈整合起来。”

最终，该公司将使用这些计算结果，研发针对特定 IDP 的专有创新药。

Relation Therapeutic：绘制疾病的病因图

另一家初创公司 Relation Therapeutics 将单细胞分析、人类遗传学、功能基因组学和机器学习相结合，以便更好地了解人体生物学的知识。

RelationTx 使用基于图形的推荐系统技术来揭示疾病中的因果关系。RelationTx 的平台可以识别生物学的具体领域，从而专注于药物研发，加速研究目前尚未得到广泛研究的疾病。

RelationTx 首席技术官 Lindsay Edwards 表示，公司的目标是改变药物研发方式，从而找到新的疾病治疗方法。

Edwards 说：“归根结底，我们的使命是更快、更高效地为患者研发出新药。Cambridge-1 帮助我们揭开了之前几乎无法理解的生物学领域，例如基因变异如何影响人体内部复杂组织和器官系统的基因表达。”

进一步了解 AI 在医疗健康领域的应用

这些初创公司将在数字生物学领域开展突破性工作，而 Cambridge-1 的创始公司已经在利用该系统的强大性能。

阿斯利康 和 NVIDIA 使用该超级计算机开发了 MegaMolBART 的最新迭代，MegaMolBART 是一种自然语言处理模型，可读取化合物的文本格式，并使用 AI 生成新的分子。该化学转换模型能够利用 NVIDIA NeMo Megatron 框架，训练带有 10 亿多参数的化学语言模型。

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原文标题：GTC22 | 首批初创公司率先使用英国最强大的超级计算机，实现数字生物学领域的突破

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审核编辑：汤梓红